Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Akap4Q60662 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Akap4Q60662 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Akap4Q60662 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Akap4Q60662 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Akap4Q60662 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Akap4Q60662 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Akap4Q60662 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms