Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms