Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam20cQ5MJS3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms