Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm3558Q5FWC9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm3558Q5FWC9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm3558Q5FWC9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm3558Q5FWC9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm3558Q5FWC9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm3558Q5FWC9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm3558Q5FWC9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm3558Q5FWC9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm3558Q5FWC9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm3558Q5FWC9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms