Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

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Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Zmat1Q3V0C1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Zmat1Q3V0C1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms