Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim80Q3V061 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms