Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc27Q3V036 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms