Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms