Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTH8

Arhgef9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef9Q3UTH8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgef9Q3UTH8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms