Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp30Q3UN04 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp30Q3UN04 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Usp30Q3UN04 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Usp30Q3UN04 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp30Q3UN04 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms