Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx3lQ3UIR3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms