Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cops9Q3U898 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cops9Q3U898 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cops9Q3U898 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cops9Q3U898 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cops9Q3U898 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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