Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U7U4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms