Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Hvcn1Q3U2S8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Hvcn1Q3U2S8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Hvcn1Q3U2S8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Hvcn1Q3U2S8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Hvcn1Q3U2S8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Hvcn1Q3U2S8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Hvcn1Q3U2S8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Hvcn1Q3U2S8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hvcn1Q3U2S8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms