Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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