Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Rpusd3Q14AI6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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