Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VgfQ0VGU4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VgfQ0VGU4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VgfQ0VGU4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VgfQ0VGU4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VgfQ0VGU4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VgfQ0VGU4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VgfQ0VGU4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VgfQ0VGU4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VgfQ0VGU4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VgfQ0VGU4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VgfQ0VGU4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VgfQ0VGU4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VgfQ0VGU4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VgfQ0VGU4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VgfQ0VGU4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms