Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms