Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mex3cQ05A36 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms