Protein–RNA interactions for Protein: Q03526

Itk, Tyrosine-protein kinase ITK/TSK, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItkQ03526 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ItkQ03526 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItkQ03526 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItkQ03526 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms