Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms