Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms