Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms