Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tubg1P83887 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms