Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms