Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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