Protein–RNA interactions for Protein: P61620

Sec61a1, Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61a1P61620 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec61a1P61620 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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