Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf13P61216 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Taf13P61216 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Taf13P61216 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Taf13P61216 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Taf13P61216 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Taf13P61216 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf13P61216 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf13P61216 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf13P61216 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf13P61216 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf13P61216 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf13P61216 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms