Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm2P58774 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms