Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms