Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd5P56812 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms