Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApodP51910 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ApodP51910 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ApodP51910 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApodP51910 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApodP51910 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApodP51910 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApodP51910 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApodP51910 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApodP51910 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApodP51910 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApodP51910 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApodP51910 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApodP51910 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApodP51910 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApodP51910 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApodP51910 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApodP51910 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApodP51910 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApodP51910 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApodP51910 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApodP51910 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ApodP51910 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApodP51910 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApodP51910 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApodP51910 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApodP51910 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApodP51910 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApodP51910 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApodP51910 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApodP51910 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApodP51910 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApodP51910 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApodP51910 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApodP51910 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApodP51910 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms