Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox2P48432 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms