Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms