Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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