Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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