Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3P27659 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms