Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms