Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms