Protein–RNA interactions for Protein: P15116

Cdh2, Cadherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh2P15116 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh2P15116 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms