Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms