Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprqP0C5E4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms