Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtaP09225 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtaP09225 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LtaP09225 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LtaP09225 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtaP09225 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtaP09225 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtaP09225 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtaP09225 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtaP09225 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtaP09225 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms