Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01657 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01657 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01657 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01657 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01657 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01657 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01657 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01657 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01657 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01657 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01657 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01657 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01657 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01657 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01657 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01657 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01657 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01657 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms