Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp8O89110 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms