Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
JtbO88824 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
JtbO88824 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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JtbO88824 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JtbO88824 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JtbO88824 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
JtbO88824 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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JtbO88824 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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JtbO88824 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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JtbO88824 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JtbO88824 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JtbO88824 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JtbO88824 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JtbO88824 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JtbO88824 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
JtbO88824 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JtbO88824 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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JtbO88824 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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