Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms