Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2f6O54917 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2f6O54917 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms