Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms