Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb10O35955 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms